Muchos se encontraron con un problema muy particular con estos dos actores (parezco periodista 
), y es que, en WordPress, hay otra librería que usa la función $(), por lo que no se llama a la correspondiente de jQuery. Así que esto no funciona:
$(document).ready(function(){
alert('test');
});
Esto se arregla muy facilmente, incluyan esta línea al principio de su script:
$j = jQuery.noConflict();
Y reemplacen cada $ que tengan en el código con $j (puede ser cualquier cosa precedida por $):
$j(document).ready(function(){
alert('test');
});
Otra solución: simplemente reemplazar cada $ por jQuery:
jQuery(document).ready(function(){
alert('test');
});
EDITADO. Recién estaba viendo la página de jQuery, y explican un par de métodos. Para no transcribirlo, pueden echarle un vistazo: Atajos para jQuery, en el caso de trabajar con otra librería (como Prototype).
Ahora dejen de llorar, arreglen sus scripts y sigan desarrollando.
PD: si no les carga jQuery (la librería, no hablo de los scripts), pongan esto en el functions.php de su theme.
function my_jquery_load() {
if (!is_admin()) {
wp_deregister_script('jquery');
wp_register_script('jquery', '/wp-includes/js/jquery/jquery.js', false, '1.4.2');
wp_enqueue_script('jquery');
}
}
add_action('init', 'my_jquery_load');
. Esta vez es un theme más minimalista, en blanco y negro, con links colorinches (?). Aún me estoy fijando algunas cositas, pero creo que está para pasar a producción 
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).